El cáncer de mama es uno de los cánceres más comunes en mujeres alrededor del mundo. Para su diagnóstico, los patólogos evalúan la expresión de marcadores como la proteína HER2 usando inmunohistoquímica sobre tejido extraído mediante una biopsia. Esta evaluación se realiza vía inspección microscópica, estimando la intensidad e integridad de la tinción en las membranas celulares y asignando un puntaje como 0 (negativo), 1+, 2+ o 3+ (positivo): una decisión subjetiva que depende de la interpretación del patólogo.
Esta investigación en curso tiene como objetivo lograr consenso entre las opiniones de patólogos para biopsias HER2 de cáncer de mama. Para ello, se generó un dataset con 1,250 secciones rectangulares de biopsias. Para capturar las opiniones de los expertos, se implementó una aplicación Android, que además permite realizar un análisis de variabilidad intra e inter-expertos. Actualmente, hay seis patólogos chilenos trabajando en la clasificación manual de las secciones de biopsias.
La libre disponibilidad del GS de cáncer de mama será una muy significativa contribución a la comunidad científica, pues hasta el momento no existe uno para evaluación de sobreexpresión de HER2. Además, el impacto en la sociedad y la salud pública del país es directo, puesto que permite contar con una herramienta de apoyo al diagnóstico médico más preciso que el que se provee en la actualidad, desarrollada en base a muestras recolectadas en laboratorios del país, trabajando con los protocolos de los laboratorios nacionales y con opinión de expertos referentes chilenos. Asimismo, los GS generados constituyen una herramienta de mucha utilidad en la formación y entrenamiento de futuros especialistas.
Publicación:
Violeta Chang (2018) Generation of a HER2 Breast Cancer Gold-Standard
Using Supervised Learning from Multiple Experts. In: Stoyanov D. et
al. (eds) Intravascular Imaging and Computer Assisted Stenting and
Large-Scale Annotation of Biomedical Data and Expert Label Synthesis.
LABELS 2018, CVII 2018, STENT 2018, held in conjunction with MICCAI
2018, Granada, Spain, September 2018. Lecture Notes in Computer
Science, vol 11043, pp 45-54, Springer.
Proyectos asociados:
FONDEF D11I1096, 2012 – 2015, Facultad de Medicina, Facultad de Odontología, U-Chile, Xperts Ltda, Mattoli Ing, Santiago, Chile
FONDECYT 3160559, 11/2015 – 01/2019, Facultad de Medicina, U-Chile